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Igenomics：世界上第一个在口袋里的DNA“Tricorder”

时间：2022-05-21 16:25:07 来源：

Aspyn Palatnick在寒春港实验室的125周年纪念公寓举行了世界上第一个移动遗传学实验室。新的iPhone应用程序，IGENOMICS，DNA分析仪和牛津纳米孔的USB大小的组合，DNA测序仪，使基因组分析便携和可访问。

冷泉港实验室（CSHL）科学家们开发了世界上第一个移动基因组序列分析仪，一个名为Igenomics的新款iPhone应用程序。通过将iPhone与手持DNA测序器配对，用户可以创建一个移动遗传学实验室，让人想起星际迷航中的“三角机”。IGENOMICS应用程序完全在IOS设备上运行，减少了对该领域的笔记本电脑或大型设备的需求，这对于大流行和生态工人有用。Aspyn Palatnick在CSHL兼职的Igenomics中的Igenomics Michael Schatz的实验室教授，在八年后，他是一名14岁的高中实习生。

IPhone应用程序是开发的，以补充牛津纳米莫博士的微小DNA测序装置。Palatnick现在在Facebook上的软件工程师在加入Schatz实验室时已经在建立iPhone应用程序时经历过。他和Schatz意识到：

“随着测序者继续变小，没有技术可以让您在移动设备上学习DNA。大多数研究DNA：对齐，分析，在大型服务器集群或高端笔记本电脑上完成。“

15岁的aspyn palatnick在2013年在寒冷的春天港实验室学习迈克尔·施塔茨实验室基因组分析的基础知识。

Schatz认识到科学家学习Pandemics的“穿着纳米孔和笔记本电脑和其他服务器的手提箱飞行，以便在远程领域进行分析。” Igenomics通过使基因组研究更具便携，可访问，可负担得起的帮助。

用户可以通过彼此进行排序数据，使DNA分析能够在最远程位置 - 即使没有互联网访问。 Schatz描述了Igenomics甚至可能进入宇航员手中的方式：

“在太空中进行DNA测序有很多兴趣。我想看看是否有办法我们可以在那里获得iGenomics。有很多人有兴趣做到这一点。这是一个真实证明，你知道如何做到的是常规计算机的任何分析。带给你的是不可能的。“

在吉通力学期刊中，Palatnick和Schatz报告了Igenomics算法可以快速地图病毒病原体的DNA序列，例如流感病毒或Zika病毒，并鉴定诊断和治疗的突变。他们还提供了一个用于分析其他病毒基因组的在线教程，例如来自SARS-COV-2患者。

Schatz梦想这个设备将有助于现场工人和公民科学家的人：

“今天，我们都在我们的口袋里携带专业的相机，所以在接下来的几年里，我们都在难以想象的是，我们也在我们的智能手机上携带自己的DNA序列。只有这么多机会来进行环境测量并寻找病原体，甚至可能扫描自己。“

参考：“Igenomics：由Aspyn Palatnick，Bin Zhou，Elodie Ghedin和Michael C Schatz的综合DNA序列分析，2020年12月7日，吉通.DOI：
10.1093 / gigascience / giaa138


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